概述
BioSkryb Genomics 的 ResolveDNA?采用PTA (Primary Template-directed Amplification)原代模板定向擴增技術,其核心要點在于,采用抗核酸外切酶活性的終結子 (化學修飾的核苷酸) 實現擬線性擴增 (quasi-linear process),絕大多數擴增子來源于原始模板的擴增,擴增產物無法再次被復制,因此擴增過程產生的錯誤不會被放大,并且Phi29 DNA 聚合酶可減少擴增錯誤率,此外,還可以擴增線粒體基因組 (Mitochondrial Genome)。該技術可將單細胞核內微量的DNA高保真、高均一、高產率地擴增至可測序水平,靈敏、準確地檢測各種基因變異(包括單細胞SNV和CNV),實現超過95%的基因組覆蓋及優于其他方法的高保真性和均一性。系統
無論是低起始量的DNA樣本還是單細胞都可以進行精確擴增,可捕獲大于95%的基因組,并且具有很高的重現性。
以高覆蓋度、低復制錯誤和低等位基因偏差進行均一性擴增,
在全基因組測序 (WGS)、全外顯子組測序 (WES) 和small panel水平準確檢測單核苷酸變異 (SNV)。
1.起始量為4pg~10ng
2.擬線性擴增
擴增片段的長度受控(免于后續片段化流程,同時減少偏好)
雙鏈產物 (可直接連接反應建庫)
擴增產物無法作為模板再次復制(避免錯誤和偏好性放大)
3.一致的、從單細胞起始可達μg級的收率
可滿足后續穩定高質量的建庫流程
可滿足后續PCR-Free的分析流程
4.重現性好,極低的NTC對照收率
可對同一樣品進行重復分析 (Cell-to-cell Reproducibility)
只有目標模板可被擴增,非特異性擴增的發生率極低
參數
無論是低起始量的DNA樣本還是單細胞都可以進行精確擴增,可捕獲大于95%的基因組,并且具有很高的重現性。
以高覆蓋度、低復制錯誤和低等位基因偏差進行均一性擴增,
在全基因組測序 (WGS)、全外顯子組測序 (WES) 和small panel水平準確檢測單核苷酸變異 (SNV)。
1.起始量為4pg~10ng
2.擬線性擴增
擴增片段的長度受控(免于后續片段化流程,同時減少偏好)
雙鏈產物 (可直接連接反應建庫)
擴增產物無法作為模板再次復制(避免錯誤和偏好性放大)
3.一致的、從單細胞起始可達μg級的收率
可滿足后續穩定高質量的建庫流程
可滿足后續PCR-Free的分析流程
4.重現性好,極低的NTC對照收率
可對同一樣品進行重復分析 (Cell-to-cell Reproducibility)
只有目標模板可被擴增,非特異性擴增的發生率極低
流程

應用
